奈曼旗机构编制委员会办公室是奈曼旗机构编制委员会的常设办事机构，在编委的直接领导下，具体负责全旗各级行政事业单位行政管理体制改革、政府机构改革和事业单位机构改革工作，是统一管理全旗各级机关和事业单位职能配置和内设机构、人员编制、领导职数的正科级职能部门，列旗委机构序列。

奈曼旗机构编制委员会办公室（挂奈曼旗事业单位登记管理局牌子）核定行政编制4名，事业编制4名，核定科级领导职数2名（1正1副），设综合组、事业单位登记管理组2个股级内设机构，下设事业单位登记管理中心、机构编制电子政务信息中心2个股级事业单位。